Трансректальне УЗД є базовим проктологічним дослідженням у разі підозри лікарем змін у задньому проході та періанальній ділянці, повну картину яких неможливо оцінити за аноскопії.
Одним із основних застосувань трансректального УЗД є визначення перебігу періанальних нориць або локалізації періанальних абсцесів, які можуть з'явитися, зокрема, й у пацієнтів із хворобою Корна. Також дозволяє визначити ураження м'язів анального сфінктера у разі нетримання калу жінками після природних пологів, людьми похилого віку й після операцій навколо заднього проходу. На підставі ультразвукового трансректального зображення ми також визначаємо стадію раку анального каналу, плануючи оперативне лікування. Знання ступеня ураження тканин пухлиною і вибір адекватного хірургічного методу, що щадить, можуть допомогти позбутися багатьом пацієнтам дискомфорту, пов'язаного з необхідністю створення кишкового свища (так званої стоми).