Defekografia polega wykonaniu serii zdjęć RTG podczas procesu wypróżnienia (w 4 jego fazach – spoczynku, wstrzymywaniu, parciu i defekacji) w pozycji fizjologicznej i późniejszej ocenie wyglądu oraz anatomii wszystkich struktur dna miednicy.
Taki sposób przeprowadzenia defekografii pozwala na uchwycenie zmian w układzie mięśni i narządów umiejscowionych dookoła odbytu w trakcie procesu wypróżniania w zwyczajowej pozycji ciała, co daje szansę na uchwycenie odchyleń od normy niewidocznych w innych badaniach obrazowych (rezonans, tomografia komputerowa, USG transrektalne) oraz standardowym fizykalnym badaniu proktologicznym.
Badanie stosowane jest w diagnostyce zaparć, nietrzymania stolca, zespołu paradoksalnego skurczu mięśnia łonowo-odbytniczego, wypadania odbytnicy i rectocele - czyli przepukliny odbytniczo-pochwowej.